本书由前言、正文（包括译文和注释）、原文（《蒙古秘史校勘本》）、原文拉丁文转写、索引及参考书目组成。为忠实地保存700多年前《蒙古秘史》的读音，作者参照中世纪中原汉字读音，第一次将《蒙古秘史校勘本》转写成拉丁文。《新译集注〈蒙古秘史〉》注释的每一个词条（包括索引）都是使用汉文、拉丁文、现代蒙古文3种文字书写。