19世纪初，当权者和一些民间组织开始研究除贝尔蒙特家族所掌握的神圣力量外，其他对抗德古拉的方法。这些研究基本上都已失败告终。“圣教”就是这样的一个民间组织。就在教会即将解散的前夕，首领巴罗突然有了一个惊人的成果。他发现了一种叫做“刻印”的技术，将某种力量植入某些特定的人身体内，从而达到使用该力量的效果，而最强大的、足以摧毁德古拉伯爵灵魂的的刻印被称做“多米纳斯”。就在多米纳斯的仪式中巴罗的徒弟之一阿鲁巴斯介入导致仪式失败，并让义妹夏诺雅丧失了记忆与感情。 　　记忆丧失的夏诺雅开始寻找离开圣教的阿鲁巴斯，准备取回被夺走的三个多米纳斯刻印。后来，夏诺雅才知道阿鲁巴斯是因为不想让她自己使用刻印致死才破坏了仪式，失去了义兄的她回到师父身边后又发现了一直以来辅养自己长大的恩师已被多米纳斯的邪恶意念所操控。 　　为阻止师父临死前召唤的魔王德古拉重回人间，也为替老师赎清罪孽。最终决战时夏诺雅发动了三个多米纳斯刻印欲与之同归于尽，阿鲁巴斯的灵魂在最后保护了夏诺雅，并让失去感情和记忆的夏诺雅重新找回了自己的感情和记忆，重拾感情的夏诺雅，终于露出了自己的第一次微笑。