矢賴光一和操栖老師一行人在海邊發現了一座貌似燈塔的建築，為了逃離羅德侯鯨的包圍，他們躲進了那座塔，並對它展開了調查。同一時間，仙石集團也在別座塔進行調查，不過，有二名可疑的男人正悄悄接近他們的基地……