在三年前某个晴朗的假日，还是初中生模样的工藤新一正在公园大秀球技。这时，一个面带忧郁的男子走过来，向他询问3天前是否在公园看到一个男孩。新一摇头否认，男人于是转而询问其他的人。此时新一却发现，就在不远的地方有两个神秘之人密切观察着他们。经进一步了解得知，那个男人名叫秋元宏一，在东京标准局工作，他被警察怀疑杀害了自己的奶奶，而他的供词又漏洞百出，因此秋元才四处寻找能够证明自己不在场的目击证人。
经过新一的启发，秋元记起曾有一白衣女子牵着黑色的狗经过他的身边。以此为契机，新一和秋元开始寻找目击证人……