目录学对于学者冶学有重要的辅导作用，余嘉锡先生认为目录学的根本意义在于“辨章学术，考镜源流“。在此思想指导下，这本书对目录学的发展源流各种体制的利弊得失、历代书目的类例沿革都作了详尽的探讨，被杨树达先生誉为”透辟精审“之作。《目录学发微》与《古书通例》互相呼应，最好合读，故三书将《古书通例》附于后，以资参阅。《古书通例》亦是余锡先生理要的学术著作，周祖谟先生认为此书虽篇章不多，“而探微索隐，足以解颖释惑。读者据此举一反三，所知自多”。