宇宙由无数平行的世界组成、借助奇妙的魔法神刀的切割可以彼此穿行。
生活在另一个牛津的少年威尔，遭遇着莫名追杀；在一只神秘的猫的指引下，他跨过一个秘密的窗口，来到另一个横行着吞噬成人精灵的妖怪的世界……
出于对母亲深沉的爱，威尔决定去寻找失踪多年的探险父亲。殊不知这对父子的命运早已与关系宇宙生死的巨大阴谋密不可分了……
亡命天涯的威尔遇到了继续在朝自己使命的莱拉，并偶然得到那把可以切开宇宙从而在不同世界穿梭的魔法神刀；
其实，这并非偶然，许多世纪前，就有了关于他和莱拉的神秘预言：他们即是亚当与夏娃，必须联合女巫和天使，以及所有正义的力量，帮助阿斯里尔勋爵，才能对抗强大的宗教和政治势力，揭开“尘埃”的秘密，拯救宇宙；而伊甸园那条引诱他们的蛇，则是女科学家马隆博士……