厄崔迪家族被帕迪沙皇帝和哈克南人联手灭族后，保罗·厄崔迪（提莫西·查拉梅 饰）在厄拉科斯的沙漠中遇到了预言中自己的灵魂伴侣，弗雷曼女战士契妮（赞达亚 饰）。母子二人经过一系列致命的考验后，保罗的母亲杰西卡夫人（丽贝卡·弗格森 饰）成为弗雷曼人新的圣母，保罗则以穆阿迪布之名加入弗雷曼人，并让厄拉科斯上所有的弗雷曼族群相信自己就是预言中的天外之音，传说中的救世主。一次行动中，保罗意外遇到奇迹般生还的哥尼（乔什·布洛林 饰），并在哥尼的带领下找到了厄崔迪家族留下的核弹。在沙暴的掩护下，保罗率领弗瑞曼人发动奇袭，用核弹炸开了阻挡沙暴的山壁。义军骑著沙虫攻入皇帝的行营，消灭了皇帝和哈克南人的大半军队。男爵在皇帝行营被保罗杀死，而男爵的侄子菲德-罗萨·哈克南（奥斯汀·巴特勒 饰）则代替皇帝接受了保罗的单挑，最终保罗赢下决斗成功继承帝位，并承诺迎娶皇帝的女儿伊若琅公主（弗洛伦丝·皮尤 饰）为名份上的妻子。目睹这一切的契妮无法接受保罗的变化和选择，愤而离席，留下的保罗则面临着一生所爱与宇宙命运的两难选择。