概要 恐竜帝国の総攻撃により、地球は壊滅の危機に瀕していた。だが、この日のために用意された真ゲッターロボはいまだ起動せず、メインパイロットの流竜馬も戦闘不能な状態にあった。そこで地球を守るべく、巴武蔵は単身ゲッターロボに乗りこんで恐竜帝国のメカザウルス軍団を迎え撃つ。そして武蔵はゲッター炉心を暴走させて、メカザウルス軍団を道連れにゲッターロボと共に散ったのだった。 そして、５年の月日が流れた…。 恐竜帝国は滅びていなかった。再び地上を襲い始めたメカザウルス達。だがこの日のために神隼人はネオゲッターロボを完成させていた。更に隼人は二人のパイロット、橘翔と大道剴を育て上げていた。しかしゲッターには３人のパイロットが必要だ。しかもとてつもない能力の持ち主が。やがて隼人はついに最後のパイロットを見つけ出す。恐竜兵士をも素手で倒す猛者、一文字號を。 かくして３人揃った新生ゲッターチームはネオゲッターロボを駆り、恐竜帝国との激闘を開始した。だが恐竜帝国の帝王ゴールは、脅威的な新しい力を手に入れゲッターに迫る。この戦いの果てに待つものは何か!?

自从盖塔射线被发现并作为一种重要的能源被广泛使用以来，人类已经经历了大半个世纪，但是，神秘的外星生物Inventor（来访者）自月面开始侵袭地球，人类濒临危机。于是，人们自发制造了大量的Super Robot去应战，终于击退了这些怪物。随着早乙女博士的死亡，世界盖塔射线的研究权威机构——早乙女研究所渐渐被废弃，当年杀害博士的元凶，就是原盖塔队队长——流龙马，如今已经被判处无期徒刑，处于监禁中，曾作为战争中拥有最强大力量的盖塔队也就此解散。 一日，原盖塔队成员——巴武藏和车弁庆在运送军方重要物资的时候，于山路上再度遇见了消失多时的Inventor，并受到了截击，巴武藏驾驶盖塔三号机应战，酣战多时，中途却被一巨大的机器人攻击，它全身深红，背后生有恶魔的翅膀，它是弑神者——真盖塔。并不知情的武藏被打成重伤，而真盖塔也同时收拾掉了Inventor，强大的力量令人咋舌，而操纵者，竟然是原本应该在３年前死去的早乙女博士。 到底是怎么回事呢？Inventor侵攻地球的谜团，盖塔射线的秘密，即将要揭晓了。！