朝鲜肃宗时期，南人党在朋党争斗中胜出，引发“己巳换局”，致使仁显王妃闵氏被逐出宫，弘文馆校理金鹏道（池贤宇 饰）全家被杀。此后金鹏道忍辱负重，全心帮助闵氏复位，并暗中监控南人首领、右议政闵黯。闵黯派出杀手追杀金鹏道灭口，千钧一发之际金鹏道身上一道符咒生效，亮光后他竟不知所踪。原来此道符咒原是艺妓尹月（陈艺瑟 饰）替他求来护身之用，却不仅关键时刻救他一命，更引领他穿越了300年的时空来到2012年，与出演仁显王后一角的小演员崔熙珍（刘仁娜 饰）邂逅。以符咒与手机为媒介，两人在数次的时空穿梭相处间互生情愫，情定彼此，在现代时空中过着温馨甜蜜的生活。 但是在金鹏道原本的时空里，他还有刀光剑影的使命要奔赴，有史书中注定的结局要逆转。留在现代与熙珍相守一生，似乎只是一个太过美好的梦想……究竟最终，这段穿梭于300年时空间的爱恋能否修成正果？

该剧以穿越时空旅行为素材，讲述了失去哥哥的男主人公获得9支能回20年前时光的神秘的香之后，开始展开一系列曲折离奇时间旅行的故事。

东都大学附属医院某夜紧急收容了一名头部受创的神秘男子，脑外科值班医生南方仁（大泽隆夫 饰）为其顺利完成手术，手术转醒后男子却莫名出逃。仁在追赶中自台阶摔下昏迷，再次醒来后发现自己已身处一片树林之中，有盘头武士在厮杀。以为在拍时代剧的仁险遭殃及，所幸被青年武士橘恭太郎（小出惠介 饰）所救。仁随负伤的恭太郎回到橘家，在极其简陋的条件下为其进行了手术。目睹手术全过程的恭太郎之妹橘咲（绫濑遥 饰）深受触动，对仁产生了浓厚的兴趣。次日早晨，仁从咲口中得知震惊的事实：自己竟穿越到了幕末的江户时代！ 自此，偌大的历史画卷逐渐铺现。以仁在医学所的浮沉及自立门户后的众多医疗事件为主线，不仅坂本龙马、胜海舟、绪方洪庵、新撰组等人物/组织悉数登场，仁更邂逅了与自己在现代的未婚妻样貌惊人相似的美丽花魁野风（中谷美纪 饰）。深感命运神奇的仁在试图将现代医疗技术引入江户的同时，也努力扭转着历史洪流中众人命定的走向。 本剧改编自日本漫画家村上纪香同名漫画代表作，TV版完结篇亦已于2011年播出。

《仁医2》完结篇延续前篇剧情，历史依旧向着既定方向有条不紊的前行，更多耳熟能详的历史角色悉数登场。南方仁（大泽隆夫 饰）以大夫的身份在江户时代生存了下来，所开设的医馆仁友堂亦步入正轨。一天他得知橘咲（绫濑遥 饰）的母亲患了当时普遍的脚气病，由此决意制作并普及可治愈该病的点心。与此同时，坂本龙马（内野圣阳 饰）出现在仁面前请求帮助。仁随龙马来到京都救治胜海舟的师父佐久间象山，竟从苏醒的后者口中得知了惊人的往事……禁门之变后京都满目疮痍，原本留下救人的仁被新撰组带至萨摩藩救治西乡隆盛。此后，坂本龙马牵线西乡隆盛与长州藩，促成萨长同盟。 亲历着幕末日本局势的陡然巨变，仁对自己之于这个时代意义有了崭新的认识。在不远的未来，他将重新邂逅寻找新生活的野风（中谷美纪 饰），前篇中围绕在他们周身的谜团亦将逐一得到解答。