20世纪末，一种被称为“B细胞”的物质被发现存在于生物体内，这种物质会直接侵入生物的DNA内部，使其产生异变。科学家们对这种奇妙的物质产生了极大的兴趣，为此进行了多次动物实验，并秘密地准备将B细胞用在人体上。高中生海堂佑司在不知不觉中成为了牺牲品，也因B细胞的活性化而被诊为不治之症，进入了精心安排下的冷冻睡眠。在这段时间内，由于动物体内的B细胞无法通过冷冻来抑制，使其发生了突变增殖引发了物种变化，兔子和小狗成为了巨大的虫状怪物 BLUE。它们在很短的时间内交配繁殖，并将人类当作了自己的食物。整个世界很快就被数量庞大的BLUE所占据，只有1千万左右被选出的人逃到了太空殖民地“第二地球”里，而剩下的人类却只能留在地面上被BLUE所蹂躏……
人类的手亲手造出了罪孽，人类的手再次将自己推向无尽的深渊，不是天灾，不是虫孽，只是人祸而已……

幕府时代末期，外忧内患，山河动荡，百姓生活困苦，且生命时刻受到威胁。少年心太因其善良纯洁之心感动飞天御剑流高手比古清十郎，被其收入门下学习剑法，更名剑心。
在国家危难之际，年轻的剑心怀揣改变时代的梦想下山，加入奇兵队，日后更被桂小五郎纳入麾下，以刽子手的身份为时代的变革尽一份绵薄之力。年仅15岁的剑心接连刺杀多名政府要员，令对手闻风丧胆，直到某一天，一名下级武士在他的脸上留下一道无法愈合的伤疤。
来至京都寻找爱人的雪代巴邂逅了剑心，正是眼前这名瘦弱的男子将爱人从她的生命中带走。巴走入剑心的生活，随之经历了政治斗争的血雨腥风和田园乡下的宁静淡雅。也许她正是剑心那把狂舞之刀的刀鞘，但在大时代的背景之下，两个人的渺小幸福一触即碎……

商务公司的小课长田中王儿是个普通的上班族，天天过着庸庸碌碌的日子，谁也想不到他15年前曾是摇滚乐团“BLACK HEAVEN”中的吉他手。某天，王儿面前出现了一位知晓他过去的神秘美女，并将王儿至爱的吉他放进他的手中。她说自己是来自宇宙的战舰指挥官，只要有他的音乐她就可以获得胜利……
该片的宣传口号是“一支吉他就可以拯救地球”，在科幻题材作品中这样的构思和剧情都是比较少见的。以一位而立之年的男性作为主角也颇令看惯了俊男美女的观众感到意外，片中主人公在理想和现实之间挣扎的过程具有很强的真实感。此外，片中的配乐充满摇滚风格，由美式动漫及英文摇滚组成的OP也给人留下了深刻的印象。