日本警视厅特殊部队（SIT）小队长濑文焚流（加濑亮 饰），在一次执行任务时遭遇队友的离奇死亡，面对高层他百口莫辩，最终被调职到公安部公安第五课——不明事件调查科。该部门专门调查一些匪夷所思的超自然案件，当然在所谓“科学昌明”的现代化社会，这也意味着第五课是一个很难得到认可的边缘部门。除濑文外，第五课只有油滑的上司野野村光太郎和智商高达201的怪女孩当麻纱绫（户田惠梨香 饰）。在此期间，预言师、神之手等各种各样拥有超能力（SPEC）的人物接连登场。
濑文在和当麻办案的过程中，渐渐趋近了一个鲜为人知且充满阴谋和秘密的未知世界……

故事承接第一部，讲述二叶廉太郎（松本润饰）、贵田春彦（大野智饰）、恩田琢磨（二宫和也饰）、鸭川忠（樱井翔饰）和冈野瞬（相叶雅纪饰）五位少年自高校毕业后，各自展开自己的人生之路。在相隔三年之后的某一天，在机缘巧合下几人重新聚首在一起。在美国从事音乐活动的恩田琢磨突然回到日本，而二叶廉太郎却行踪不明。再次相逢在一起的四人，回到了当时合租的八盐住宅区。然而物是人非的是，正在计划新建高级住宅城的自治团体与反对改建的居民之间发生了激烈的纠纷。
由日本导演堤幸彦执导的青春电影《生活艰难所以快乐》，由日本五人偶像组合杰尼斯偶像团体岚担任主演。