“藏经中云，新尸气变，化阴摩罗鬼，其形如鹤，色黑，目光如灯火，震翅高鸣。” 由良昂允伯爵是一个与世隔绝的人，隐居在白桦湖附近的“鸟城”之中，不但是个鸟类专家，也是一个博学的儒学者。伯爵在几十年间曾经四次娶妻，而四位新娘都在新婚之后的第二天早上离奇死亡。似乎并没有凶手，甚至看起来连作案的时间都没有，是不可能的犯罪吗？书斋中伫立着的巨大漆黑的鹤就是阴摩罗鬼吗？伯爵即将第五次娶妻，这一次他下定决心无论如何都要保住新娘。

中禅寺敦子为采访古剎，偕同鸟口守彦进入箱根荒僻深山，不料他们下榻的旅馆却在雪地中凭空出现呈坐禅姿势的僧人尸体。 京极堂受邀调查从土堆中挖掘出的书库，孰料其中不但满是禅学经典，更有「不可能存在的东西」，他所指为何？ 穿着盛装和服在荒凉雪地漫游的吟歌少女，十三年来不曾长大？十多年前的一场大火，如何将僧人禁锢寺内十三年？向盲眼按摩师坦承自己杀人的和尚，却又改口说杀的是牛，自己是老鼠！ 年代、派别来历及财源都不明的谜样古剎明慧寺，史书记载中遍觅无踪的明慧寺，寺内僧人接二连三死于非命，甚而巨鼠成群流窜、四处啃咬，向来气定神闲的京极堂遭逢前所未有的难关……