《魍魉之匣》改编自京极夏彦百鬼夜行系列的第二部作品。 榎木津礼二郎（阿部宽 饰）经营侦探事务所。一天，原电影明星柚木阳子（黑木瞳 饰）委托其受理她14岁的女儿加菜子（寺岛咲 饰）失踪一案。作家关口巽（椎名桔平 饰）和记者鸟口守彦（Magy 饰）对最近发生的美少女被肢解杀人事件十分好奇，一起前往现场追查，却在路途中迷路而误入一栋奇怪的盒状建筑物。负责侦破连续杀人事件的青木警官（堀部圭亮 饰）乘坐的列车上加菜子被撞下车送往医院。刑警木场修（宫迫博之 饰）强忍疲惫下接手处理案件，却发现加菜子的母亲，正是他暗恋多年的阳子。但日，运送加菜子的救护车和随同车辆消失在了匣馆的领地中。 消失的少女、相模湖分尸杀人案、追查案件的木场和关口、盒子般奇怪的建筑物，到底是什么将他们联系在一起？魍魉，真的只存在人心吗？

25岁的井上薰（冈田准一饰）是东京警视厅警备部的SP，即security police，工作是保护政要人物的安全，但并不具有抓捕犯人的权力。由于儿时目睹父母在恐怖活动中身亡的场面，井上具有神奇的意念感应能力和异常敏锐的观察力，明明是在搜索疑犯，却被误会为发呆，让人质疑他的工作能力。由于井上总是违反要求，直接去逮捕恐怖分子，这使他的同事们颇为不满。好在有上司尾形总一郎（堤真一饰）的时时维护，井上才免于上头的责罚。 现实生活中，井上希望拥有一个女朋友，但机械地说出“请以结婚为前提和我交往”以及紧张的精神状态总是把女孩子吓跑，和同事笹本絵里（真木よう子饰）的打闹中亦有擦出花火。

Teenage Mutsuko comes to Tokyo for work but ends up at a repair shop. She befriends the owner's family. Neighbors Hiromi, writer Chagawa with admirer Junnosuke strive alongside them in postwar Tokyo's evolution.