故事发生在某个晴朗的下午，鲁鲁修与娜娜莉一起度过着安稳的时间。突然，娜娜莉向鲁鲁修请求：“想再听以前在皇宫的庭院哥哥讲的那些充满快乐的故事”。为了满足自己珍爱的妹妹的希望，于是鲁鲁修对《CODE GEASS》系列的登场人物使用GEASS的力量。“鲁鲁修・V・不列颠尼亚命令，《CODE GEASS》的角色们啊，成为我所讲故事的登场人物吧，使我最爱的妹妹娜娜莉高兴！”就这样开始了《CODE GEASS》历史上最大规模的GEASS浪费，新的不思议之国的故事就此上演。

故事发生在明星学园的十年黑组之中，那是一个由十二名顶尖暗杀者所组成的神秘班级，这一次，致使她们齐聚一堂的，是一位名叫一之濑晴（金元寿子 配音）的平凡女生，她是这十二个冷酷杀手共同的目标。尽管身为众矢之的，但晴依旧信心满满，她的理想只有一个，那就是活到毕业的那一天。 东兔角（诹访彩花 配音）是十二名杀手之一，也是资历最老的前辈之一，然而，冷若冰霜的她却被晴的乐观和开朗渐渐吸引，杀心转变成为了爱心，最终，东兔角反而成为了晴的保护着。面对这曾经是同伴的另外十一人，东兔角能否保护晴免遭杀身之祸呢？又是谁要如此大动干戈夺取晴的性命呢？