故事发生在遥远的未来，肆虐的异生兽给人类的安全带来了巨大的困扰，为了抵挡异兽的进攻，日本政府成立了防卫组织TLT，其中，夜袭队拥有着最强大的实力和最强劲的武器，是整个组织内部的中坚力量。 然而，面对经过了进化的新型异生兽，夜袭队亦束手无策，在这个节骨眼上，光之巨人奈克瑟斯奥特曼和它的适能者姫矢准（桐岛优介 饰）出现了。在奈克瑟斯奥特曼创造出的美塔领域中，奥特曼和异兽之间展开了激烈的斗争。孤门一辉（川久保拓司 饰）是TLT里的新进成员，当他目睹了奈克瑟斯奥特曼强大的力量后，开始对奥特曼的起源和姬矢准的神秘过往产生了兴趣。

本作的主人公是在光中消失的宇航飞行员的儿子。当时的他还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。 但传说战士长大之后加入了地球和平联合组织TPC，最初他在宇宙发射中心工作，后进入SUPER GUTS（超级胜利队）的学员训练班。在一次模拟战争中一举击败了SUPER GUTS的王牌飞行员由美村良，然而此时他却遇到了宇宙球体“斯菲亚”，虽然他奋力战斗，却寡不敌众。此时他看见了神秘的光，突然成为了戴拿奥特曼的人间体。当他清醒过来时，已经莫名其妙地成为了SUPER GUTS的队员了，是由美村举荐了他。 在火星的一次战斗中，斯菲亚与岩石合体，变成了怪兽。传说英雄在和它战斗时，身陷险境，此时他的身体发出闪亮的光。这时，他变成了新的光之巨人，以强大的实力击败了达兰比尔。当他恢复回原来的样子时，他的脚边出现了神秘的变身器——闪光剑。 之后超级胜利队的绿川麻衣给这个新的奥特曼起名“戴拿奥特曼”，光之巨人的故事开始了。