Set on an island off the coast of New England in the summer of 1965, Moonrise Kingdom tells the story of two twelve-year-olds who fall in love, make a secret pact, and run away together into the wilderness. As various authorities try to hunt them down, a violent storm is brewing off-shore – and the peaceful island community is turned upside down in more ways than anyone can handle.

20世纪60年代，安保运动如火如荼，日本社会动荡不安。这份躁动肆意延伸，继而连家庭亲人间也无法避免。青年左兵（吉沢健 饰）是全共斗的一名成员，时常活跃在革命运动的第一线。而他的哥哥则是一名警察，不同的阶级立场令流着相同血液的兄弟俩时常发生争吵。某个晚上，愤怒的哥哥对左兵拳脚相向，嫂子袖里（武藤洋子 饰）从旁奋力阻拦，却无意间枪杀了丈夫。 在此之后，左兵将哥哥伪装成自杀的场面，随后带着袖里逃亡。逃亡期间，袖里为自责所折磨，痛苦不堪，这两个同病相怜的人儿最终坠入爱河。一路向北的逃亡之旅，不知何时是一个终点……