因羽田机场天气情况不佳，一架飞往东京的航班暂时停靠在一天只有两架飞机降落的松本机场。地勤大河内千草（竹内结子 饰）严阵以待，打起十二万分的精神应对旅客的各种要求，此外还为村木主任（甲本雅裕 饰）死缠烂打的求婚告白颇费脑筋。少顷，刚刚结束葬礼的鹤桥一家抵达候机大厅。长男藏之介（生瀬胜久 饰）一心筹划兴建天文馆，为此缠着妹妹和妹夫借钱。身为律师的妹夫田野仓守男（香川照之 饰）道貌岸然，情人百合子（户田惠梨香 饰）暗中随行令他焦灼万分。妻子美代子（神野三铃 饰）察觉丈夫的异状只能自吞苦果，这时却邂逅了帅气的飞行员（小田切让 饰）。田野仓的一双儿女也各有各的心事，丈人鹤桥清正（绫田俊树 饰）则抱着亡妻的骨灰独坐一隅。 千草周旋在鹤桥一家身边，不经意间得知了他们的许多秘密，也见证着他们之间隐隐的羁绊……

Mysteries are revealed like the words "Simple Plan," "Third Secret of Fatima" and also the mysterious white man which are all mentioned in the movie "SPEC: Heaven".

第二季的故事将从上一季最后一集的情节拉开帷幕。 警视厅搜查一科“特别犯罪对策室”被迫解散，室长大泽绘里子（天海佑希 饰）引咎辞职，准备从成田机场出发回去美国，可是就在机场等待时她接到了野立信次郎（竹野内丰 饰）的电话。警界高官黑原健蔵将成为反政府组织“黑月”的下一个狙击目标，而“黑月”重要成员高仓龙平在护送中逃脱。虽然绘里子和对策室各成员纷纷赶往现场，但黑原依然中弹，而犯人逃脱。身负重伤的黑原被迫辞职，为了承担责任，对策室再度解散，绘里子去了美国。两年后，当上参事官的野立以接手某个重要案件为契机，使得对策室再度复活。 木元真实（户田惠梨香 饰），片桐琢磨(玉山铁二 饰) ，花形一平(沟端淳平 饰) ， 山村启辅(温水洋一 饰) 和岩井善治(小林友治 饰) ，这一班乌合之众是否还能再次聚首，为绘里子和对策室效力？而野立这一次是否依然可以说服绘里子担任室长一职？

特别篇继续延续着第一季的故事。没有听从指挥的实习生五人组蓝泽耕作（山下智久 饰）、白石惠（新垣结衣 饰）、绯山美帆子（户田惠梨香 饰）、冴岛遥（比嘉爱末 饰）和藤川一男（浅利阳介 饰）被要求停止工作一周进行反思。这一周里，五人各进行着不一样的事情。因为上一季的意外事故，失去右手的黑田医生（柳叶敏郎 饰）则开始进行康复训练。 回归岗位后的五人组，遇到了列车出轨事故。列车上乘客众多，死伤惨重。实习生们和医生分批乘坐救援飞机奔赴现场。现场一片混乱，生与死的搏斗场，让实习生们只能争分夺秒。并且，灾难似乎也在慢慢靠近实习生中的一员……