遺跡に眠っていた旧時代の惑星殲滅用兵器が目覚めようとしていた……。
ニナは黒い谷のマシロたちに合流するも、何も出来ない自分にひとり悩んでいた。一方アリカはマシロを探しに向かう。ナツキたちは惑星殲滅兵器対策にヴィントに戻る。遂に各国の惑星殲滅兵器が復活してしまい、各国オトメたちが応戦するも、善戦むなしく惑星エアルの最大の危機が迫る。マイスターオトメを次々に石化した敵・真祖も完全体となり、マシロたちの前に立ちふさがる。絶体絶命のマシロたちの前にアリカが合流するが……。