普通の女子高生・桜小路桜はある夜、青い炎で悪人を燃やす謎の少年を目撃する！　しかし翌朝、現場となった公園には何の痕跡も残っていなかった。自分の見たものが現実だったのか思い悩む桜、その前に昨夜の少年が転校生として現れた！彼は何者なのか？そして青い炎は何だったのか？　謎を解くため桜は少年に近づいていく！！「捜シ者」との激闘を終え、平穏ながらどこか気の抜けた日々を送る大神にこれまで見たことの無いロストが起こる！！　他の「ＣＯＤＥ：ＢＲＥＡＫＥＲ」達もロストし、　さらに大型台風の到来とクラスメイトの訪問も重なって、大パニックの夜が始まる。だが全ては新たな敵への序章でしかなかった！！