因为父母得了传染病一夜之间双亡，变成孤儿深受打击的九岁的美亚丽（富永美伊奈 配音）从出生地印度，做船来到了英国舅舅家中。舅舅的家在荒野的郊外，是一个特别大而神秘并且阴森森的庄园。舅舅是个古怪的人，美亚丽来了也不见她，也不能去找他，更不能随便到别的房间里去。在家的时候被父母娇惯的美亚丽，在这里女管家梅朵茹对她管教很严厉，她非常思念自己的妈妈。唯一从家里带来的小猫吧唧陪伴着她。美亚丽发现了座有围墙没有入口的秘密花园，每天夜晚都能听到里面有人哭泣的声音，美亚丽的猫吧唧因被老师发现了，被管家梅多茹赶出了家，半夜还没睡觉的美亚丽在伤心时又听到了哭声......