《我的两个世界》是方舟子唯一的一部文化随笔集，“我的两个世界”意味着方舟子行走在中国和美国两种不同的文化背景下，时间跨度从1993年到2011年，将近20年的时间也可以看到方舟子思想的变化。这也是方舟子最全的一部随笔集，二十年行走，对历史的中国和自由的美国方舟子有着别样的体悟。全书逻辑缜密，虽为文化随笔，更多的透露着方舟子独立思考的精神。