白巳津川市。 学園都市であること以外になんの特色もない街。 進級してまだ間もない主人公の周りに変化が訪れる。 大地震により、白蛇九十九神社に祀られていた神器が破損し、 並行世界から所有者に特殊能力を授ける装飾品「アーティファクト」が流入した。 その人知を超える力を悪用した人体石化事件が発生したのだった。 石化事件の犯人が「魔眼のアーティファクト」の所持者と知った主人公「新海翔」は、 クラスメイトの「九條都」、妹の「新海天」と共に石化事件の調査と解決に動き始める。 調査の途中で「リグ、ヴェーダ」と名乗るアーティファクトユーザーの組織と対立をしてしまう。 その「リグ・ヴェーダ」のメンバーの中には、毎朝見かける学園の先輩「香坂春風」の姿がーー。 魔眼のユーザーの正体。 ソフィーティアの秘密。 異能に目覚めた少年少女たちの物語はついに佳境にーー。