一九一九年的一个暴风雨的夜晚，日本箱根著名旅馆富士屋饭店接到军方密令，到芦之湖码头迎接贵客。一座又小又粗陋的木制码头边，隐约有一艘大得超乎想象、挂着双头鹰家徽旗帜的军舰悄无声息地出现，看起来像亡灵一样的军人不断地从船上走出来。之后，军舰和下船的俄罗斯军人都消失无影踪，饭店员工被下封口令。
七十多年后，御手洗洁接受一位老人的临终托付，找到了当年流传下来的一张照片，破解了幽灵军舰之谜，意外地揭开了俄罗斯帝国不为人知的秘密，以及罗曼诺夫王朝末代公主安娜塔西亚的奇特遭遇。尘封半个多世纪的历史真相即将揭晓……