那是空间铁道网在全宇宙中无限扩张的未来。
人们怀抱着希望与梦想，
搭乘宇宙特快列车「银河铁道」在星际间旅行。
此时的地球已被资产阶级的机械人类统治，
买不起「机械身体」的天然人类只能住在贫民窟。
与铁郎相依为命的母亲，
在机械伯爵的一场狩猎娱乐中遭到猎杀，制成标本。
一位神秘女郎梅德尔出现在绝望的铁郎面前，
邀请他搭乘「999号」。
一心想换机械身体的铁郎接受邀请，
展开漫长遥远的旅程……
不朽的叙事诗就此揭开序幕。