《摩托车日记》配乐充分展现了知名阿根廷乐手兼拉丁摇滚制作人古斯塔沃·桑托纳拉（Gustavo Santaolalla）出色的创作才华和弹奏技艺，特色鲜明、可听性极高，有别于他惯常的清幽沉静风格。除采用多种民族乐器演绎浓厚南美风情外，他对吉他的娴熟运用最令人击节赞赏，时而恬静忧郁、时而激越奔放、时而清澈悠扬，情景交融地演绎出飞扬青春之激情、梦想与迷惘；格瓦拉心中对拉美民间苦难的悲伤与同情、对阶级对立与压迫等人间不公的愤懑、对社会和人生的深切忧思，尽在动听抒情与激情澎湃的跌宕旋律里交织升腾，引发强烈共鸣，这段心灵洗礼式的摩托浪游对恩内斯托·格瓦拉影响巨大，他在秘鲁麻疯村月夜奋身横渡亚马逊河一幕更是全片高潮，可说是他弃医从戎并立志在整个拉丁美洲创建人类新世界的分水岭，革命的启蒙火种灼热着他年轻的心———数年后他改名为切·格瓦拉，前往古巴打游击，从此一生献身于拉美民族自由解放的革命事业当中，直至39岁时在玻利维亚英勇就义。切是全球争取自由的人民心目中神圣不朽的革命偶像，一幅切蓄着长发戴贝雷帽的照片最具象征意义，在上世纪六十年代以来更演变成全球最重要的流行文化图腾。
《摩托车日记》为配乐师古斯塔沃·桑托纳拉赢得2005年阿根廷影评人协会奖最佳音乐、英国影艺学院BAFTA电影奖最佳电影音乐奖；而其中由荷西·德克勒（JorgeDrexler）创作的抒情优美的歌曲《在河彼岸》 “AlOtroLadoDelRío”亦荣获第七十七届奥斯卡奖最佳原创电影歌曲奖。